Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSDA5PKW4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSDA5PKW4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms