Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EME2A4GXA9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EME2A4GXA9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms