Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C9orf170A2RU37 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf170A2RU37 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms