Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.02■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0U1RRA0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
A0A0U1RRA0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms