Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms