Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 GLDN-210ENST00000612989 1676 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 IRAK2-201ENST00000256458 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD1B-203ENST00000456860 2805 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 PMEL-201ENST00000449260 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R26P5-201ENST00000416640 3664 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TAS1R2-201ENST00000375371 2542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 OLFML3-202ENST00000369551 1934 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 PMEL-215ENST00000550464 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC133919.3-201ENST00000621407 1804 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ALDH7A1-224ENST00000636743 2332 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SEC24A-201ENST00000322887 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CNTROB-201ENST00000380262 3769 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TPRX1-203ENST00000543508 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CDK20-203ENST00000375871 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 B3GALT5-204ENST00000398714 2341 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 NDUFAF7-202ENST00000336237 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LGALS9-203ENST00000395473 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LINC00473-205ENST00000584911 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LINC01141-203ENST00000426428 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CNBD2-204ENST00000489667 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms