Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMG20BQ9P0W2 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms