Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PDLIM3Q53GG5 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PDLIM3Q53GG5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PDLIM3Q53GG5 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PDLIM3Q53GG5 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PDLIM3Q53GG5 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PDLIM3Q53GG5 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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