Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FLJ37035-202ENST00000423178 2600 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PRKCQ-202ENST00000397176 3096 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC026904.1-201ENST00000430626 3549 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF429-201ENST00000358491 2233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 URM1-203ENST00000372853 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 STAT6-205ENST00000543873 3119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GRM4-201ENST00000374177 3590 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC004490.1-201ENST00000585593 2738 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 COPS4-206ENST00000509093 2273 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ENO4-203ENST00000409522 1840 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 OSBP2-204ENST00000407373 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RTEL1P1-201ENST00000504490 3685 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CDCA8-201ENST00000327331 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ANO1-207ENST00000530676 3289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RGS8-201ENST00000258302 5606 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC008966.1-201ENST00000502171 2367 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT2-205ENST00000397637 2880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HKR1-204ENST00000544914 2854 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LILRA4-201ENST00000291759 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TXNRD1-206ENST00000524698 1933 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 IL4R-201ENST00000170630 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 POMGNT1-202ENST00000371992 2934 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC008659.1-201ENST00000501834 1458 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZP1-201ENST00000278853 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HSH2D-206ENST00000613986 1957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN9-202ENST00000354537 2484 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PDYN-203ENST00000540134 2472 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CLNS1A-204ENST00000525428 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PDSS2-202ENST00000369037 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ENPP5-201ENST00000230565 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SRGAP2-AS1-202ENST00000437515 2504 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01845-201ENST00000518418 2012 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AF131215.6-201ENST00000602575 2014 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms