Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC245297.1-201ENST00000313342 933 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 GDPD1-205ENST00000581140 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC015802.4-203ENST00000592622 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RTP2-201ENST00000358241 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PHBP11-201ENST00000420550 809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC087163.1-201ENST00000430089 381 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PFN1P3-201ENST00000443612 402 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PFN1P4-201ENST00000450970 402 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC103925.1-201ENST00000453155 771 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RAET1G-203ENST00000479265 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RN7SL733P-201ENST00000582253 329 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC022392.1-201ENST00000609403 744 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RN7SL248P-201ENST00000615117 329 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RN7SL453P-201ENST00000620275 329 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC138907.9-201ENST00000623747 986 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RN7SKP170-201ENST00000362550 328 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TCTE1-201ENST00000371504 616 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TMEM176A-201ENST00000004103 1261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 HUS1-202ENST00000432325 1125 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms