Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 DCLRE1C-210ENST00000378289 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNFSF18Q9UNG2 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SNAP91-212ENST00000520302 4136 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ZNF552-201ENST00000391701 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 EME1-207ENST00000511648 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D31-201ENST00000287380 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 OR13A1-203ENST00000553795 2078 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AL118508.3-201ENST00000623468 1854 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ASAH1-202ENST00000314146 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 C19orf44-201ENST00000221671 3427 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 BANK1-201ENST00000322953 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ZC2HC1C-203ENST00000524913 4283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TRAF3IP3-202ENST00000367024 2331 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TP53-208ENST00000504290 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TP53-220ENST00000610623 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNFSF18Q9UNG2 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms