Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGCXP38435 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGCXP38435 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGCXP38435 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGCXP38435 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGCXP38435 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGCXP38435 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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