Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SKA1-203ENST00000417656 1095 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CYP4F60P-201ENST00000439449 549 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 UCMA-202ENST00000463405 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC116903.2-201ENST00000561674 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC073465.1-201ENST00000456671 464 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 GAPDHP76-201ENST00000512278 976 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC025257.1-201ENST00000550926 375 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 FAM95B1-214ENST00000593216 759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC010240.1-201ENST00000429606 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MTND6P9-201ENST00000458075 519 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AP003469.2-201ENST00000524369 430 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 OR10V2P-201ENST00000525296 764 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PAX6-217ENST00000481563 1587 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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