Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMPOP42166 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TMPOP42166 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMPOP42166 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMPOP42166 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMPOP42166 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TMPOP42166 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMPOP42166 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms