Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms