Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PIK3CDO00329 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CDO00329 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CDO00329 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms