Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AC091901.1-201ENST00000517722 736 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 IGHV3-60-201ENST00000521678 354 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AC011773.4-202ENST00000566000 1264 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AP005203.1-202ENST00000584204 561 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AC078899.4-201ENST00000593952 1113 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCDH10Q9P2E7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 OR52B5P-203ENST00000641694 1313 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AL356277.3-202ENST00000436672 587 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC00313-206ENST00000441283 448 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PCDH10Q9P2E7 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 OR5G5P-204ENST00000627642 621 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDH10Q9P2E7 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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