Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP2C1P98194 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms