Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSF1RP07333 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms