Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 SP140L-202ENST00000396563 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 FGFR2-203ENST00000351936 2478 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SPOCK3Q9BQ16 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ITIH5-209ENST00000613909 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SPOCK3Q9BQ16 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SPOCK3Q9BQ16 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SPOCK3Q9BQ16 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 GINS4-209ENST00000523277 3873 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LINC02078-201ENST00000592718 4237 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AL365181.2-201ENST00000606343 3222 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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