Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms