Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RPL10P13-201ENST00000550757 303 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 TSHZ3-202ENST00000558569 441 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 AC005154.1-217ENST00000584199 581 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 AC072062.1-201ENST00000617699 351 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 PCGF2-205ENST00000618506 1196 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 WDR78-202ENST00000371023 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 PES1P1-201ENST00000508165 1736 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 ZNF343-202ENST00000358413 771 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 HTATSF1P1-201ENST00000432008 984 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 ANKRD20A11P-205ENST00000442192 920 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 RN7SL674P-201ENST00000463397 275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 EHMT1-210ENST00000478940 591 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 AC093871.1-201ENST00000503815 534 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 AC079804.3-201ENST00000508367 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 AP001360.1-203ENST00000524708 464 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 ARL1-209ENST00000551671 879 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 IGHV2OR16-5-201ENST00000567458 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 AC089987.1-202ENST00000641959 426 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 MOCS1P1-201ENST00000564020 1612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NESP48681 HRH2-201ENST00000231683 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 RPL10A-201ENST00000322203 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 ZNRD1-202ENST00000359374 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 IGLV1-40-201ENST00000390299 407 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 AC074389.2-201ENST00000421380 437 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 ALG1L10P-201ENST00000437882 424 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 C21orf62-203ENST00000487113 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 AC020899.1-201ENST00000492855 602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 SNRPD2-207ENST00000588599 805 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 SMIM17-202ENST00000600547 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 Metazoa_SRP.82-201ENST00000611637 265 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 Metazoa_SRP.59-201ENST00000621376 277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 AC012486.1-201ENST00000625143 216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NESP48681 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 C1orf94-201ENST00000373374 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 AC005587.1-201ENST00000401879 592 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 RABL2A-207ENST00000409875 2282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 CBWD5-208ENST00000429800 1234 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 STYXL1-206ENST00000431581 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 AL160270.1-201ENST00000439960 631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 AC104445.1-201ENST00000460597 749 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 POPDC2-204ENST00000468801 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 SYNPR-AS1-201ENST00000488201 558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 OR1X5P-201ENST00000510464 894 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 HINFP-204ENST00000527410 1466 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 MIR3194-201ENST00000582236 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 AC090826.3-201ENST00000611178 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NESP48681 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 AC067852.6-201ENST00000591237 1736 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 AL354707.2-201ENST00000412339 422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 ZFX-AS1-201ENST00000427551 417 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 AC008937.1-201ENST00000453721 914 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 IGKV2D-24-201ENST00000462693 390 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 IGKV2-24-201ENST00000484817 390 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 RPSAP71-201ENST00000522496 872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms