Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC008870.3-201ENST00000566143 641 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ACAP1-204ENST00000570504 274 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AL137785.1-201ENST00000637466 490 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RGPD4-AS1-202ENST00000457647 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CASC15-202ENST00000561912 1449 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 KCNAB1-203ENST00000389636 1806 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ACVR1C-202ENST00000335450 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SNORA9B-201ENST00000384170 133 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RN7SL559P-201ENST00000476501 297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC104371.1-201ENST00000522077 797 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MEG3-223ENST00000524131 721 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PRAMENP-203ENST00000548391 1445 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PYY3-201ENST00000419078 213 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 YBX1P9-201ENST00000441264 679 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 LINC00332-201ENST00000455241 834 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 HPR-203ENST00000561690 634 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL589674.1-201ENST00000454401 222 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC087463.4-201ENST00000561964 448 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL133297.2-201ENST00000563162 485 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL590096.1-202ENST00000618162 580 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC073263.2-201ENST00000624835 1863 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 RN7SL255P-201ENST00000470639 296 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 IGHV1OR16-2-201ENST00000564937 349 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MYT1-205ENST00000622439 2140 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 DHRS1-202ENST00000396813 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 Z93242.2-201ENST00000445666 394 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SOX2-OT-201ENST00000460739 609 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AP002383.2-201ENST00000545768 675 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
XIRP2A4UGR9 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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