Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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USP35Q9P2H5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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