Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRMT13Q9NUP7 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRMT13Q9NUP7 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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