Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 NDRG4-254ENST00000569923 1312 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 SULT1A4-201ENST00000360423 1390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 CCDC144NL-AS1-216ENST00000582583 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 AP000866.2-201ENST00000504932 1493 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 C10orf99-201ENST00000372126 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 CST13P-202ENST00000400563 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 VN1R64P-201ENST00000424940 933 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 ZFR2-203ENST00000439086 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 BNC2-207ENST00000471301 745 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 AC007540.1-201ENST00000548473 507 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 AC109460.2-202ENST00000568057 573 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 MYL4-208ENST00000572316 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 LINC00969-263ENST00000626007 839 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NESP48681 PRAMEF20-202ENST00000602960 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 GOLGA8Q-201ENST00000562783 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 AL109618.1-201ENST00000434910 1683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 MRGPRX1-201ENST00000302797 1190 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 EXOSC1-204ENST00000370902 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 HIST1H4C-201ENST00000377803 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 AL021068.1-201ENST00000392097 911 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 AC008940.1-201ENST00000438117 785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 APOBEC3H-204ENST00000442487 988 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 LINC01697-204ENST00000458316 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 RN7SL454P-201ENST00000492744 243 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 TRIQK-213ENST00000521617 774 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 AC092329.1-201ENST00000594653 574 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 AC008993.1-201ENST00000632280 776 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NESP48681 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 BCO2-202ENST00000361053 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 GYG2P1-203ENST00000382965 149 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 AL353747.1-201ENST00000404577 267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 AL450326.1-201ENST00000442526 760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 POLR2H-205ENST00000443489 807 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 ST3GAL6-207ENST00000468553 715 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 EXTL3-AS1-204ENST00000523789 543 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 AC090376.1-202ENST00000587276 470 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NESP48681 HLA-DQA2-210ENST00000374940 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 TSPAN16-201ENST00000316737 1040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 CHCHD5-201ENST00000324913 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 MOG-219ENST00000376898 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 MPDU1-203ENST00000396501 1125 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 KRTAP4-16-201ENST00000440582 708 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 SLED1-201ENST00000506741 751 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NESP48681 AP001922.3-201ENST00000524768 842 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms