Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC087741.1-201ENST00000570309 4399 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC116553.1-201ENST00000561752 397 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CXorf40B-201ENST00000355203 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 RN7SKP245-201ENST00000364025 320 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AL450304.1-201ENST00000418657 759 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AL513478.3-201ENST00000641038 1095 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CCDC148-203ENST00000409889 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 APOBEC3H-203ENST00000421988 592 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 GAMTP2-201ENST00000430917 463 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AL355309.1-201ENST00000442158 78 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC099541.1-201ENST00000453828 670 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AL353807.2-201ENST00000456382 220 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 OR1X5P-201ENST00000510464 894 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ELOB-205ENST00000572954 331 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 FXYD3-207ENST00000604255 780 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 Metazoa_SRP.163-201ENST00000611926 277 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRXP46100 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRXP46100 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms