Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SCN2BO60939 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SCN2BO60939 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SCN2BO60939 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SCN2BO60939 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SCN2BO60939 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SCN2BO60939 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SCN2BO60939 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SCN2BO60939 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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