Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CCNH-203ENST00000504878 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CNMD-201ENST00000377962 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MTFR1L-210ENST00000474295 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC092471.2-201ENST00000637219 651 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 KRTAP13-1-201ENST00000355459 749 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 IGKV6-21-201ENST00000390256 406 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AGAP13P-201ENST00000417888 363 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC112236.2-201ENST00000608402 845 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CACNG1-201ENST00000226021 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RAET1G-203ENST00000479265 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AP005121.2-201ENST00000583306 1101 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 LINC00663-207ENST00000590092 1023 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MIR6750-201ENST00000617817 75 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC009542.2-204ENST00000636543 433 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CYLD-214ENST00000569418 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 JAML-201ENST00000292067 1959 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AL662907.1-201ENST00000622988 1360 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RNASE11-201ENST00000398008 872 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ALDOAP2-201ENST00000398050 1076 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CLK4-208ENST00000520957 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SYNGR4-201ENST00000344846 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AL139220.1-201ENST00000436802 520 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 DEDD-203ENST00000458050 2300 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 INO80C-203ENST00000441607 904 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC091057.1-201ENST00000501830 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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