Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SPOCK3Q9BQ16 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SPOCK3Q9BQ16 AL512791.2-201ENST00000615251 4609 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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SPOCK3Q9BQ16 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SPOCK3Q9BQ16 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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SPOCK3Q9BQ16 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SPOCK3Q9BQ16 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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