Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP89Q96ST8 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms