Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SLC4A5-202ENST00000358683 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZNF277-203ENST00000421043 2218 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AL365181.2-201ENST00000606343 3222 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC133065.6-201ENST00000625054 2378 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 FCRL2-201ENST00000361516 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms