Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms