Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ULK4-201ENST00000301831 4613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms