Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK8P49336 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK8P49336 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK8P49336 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK8P49336 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK8P49336 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK8P49336 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK8P49336 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK8P49336 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK8P49336 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK8P49336 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK8P49336 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK8P49336 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK8P49336 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms