Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 GPR141-201ENST00000334425 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC005154.1-223ENST00000584372 547 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TXN2-204ENST00000416967 1280 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 LSP1P3-201ENST00000449530 208 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 HKR1-222ENST00000591417 525 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TRBV22-1-201ENST00000424543 337 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 RN7SL617P-201ENST00000485298 308 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 AC020917.1-201ENST00000494084 893 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 ERGIC3-220ENST00000640748 832 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATRXP46100 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms