Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CICP3-201ENST00000440782 2455 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC138749.1-201ENST00000567652 2472 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 LINC00052-201ENST00000560153 1966 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 NTNG1-207ENST00000370073 3347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ZNF479Q96JC4 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms