Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 CHMP3-201ENST00000263856 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 BTN3A2-202ENST00000377708 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AC243972.2-201ENST00000541653 991 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 ADGRG5-202ENST00000349457 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NBR1Q14596 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 C1S-221ENST00000617865 2844 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NBR1Q14596 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms