Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ADIPOR1P2-201ENST00000554199 820 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 EIF3LP1-201ENST00000554099 1658 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 EXOC7-206ENST00000406660 718 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ARL15-205ENST00000507646 578 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC116553.1-201ENST00000561752 397 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TTLL1-202ENST00000331018 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CLDN16-202ENST00000456423 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC010280.2-201ENST00000507733 410 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC133539.1-201ENST00000562644 420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC245748.2-201ENST00000588655 574 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC007728.3-201ENST00000602304 746 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 C5orf60-208ENST00000625191 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SPDL1-216ENST00000629457 340 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 KRTAP12-4-201ENST00000391618 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL356488.1-201ENST00000429752 609 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 B9D1-213ENST00000575403 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC109826.1-203ENST00000624259 1105 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ACRBP-202ENST00000414226 1700 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 DBI-202ENST00000355857 637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC074085.2-201ENST00000416734 428 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC010240.1-201ENST00000429606 459 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FANCI-214ENST00000567996 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL669831.6-201ENST00000635557 837 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC127526.5-201ENST00000637148 1110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 MYCNOS-202ENST00000641263 1313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AGA-201ENST00000264595 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SNORA80B-201ENST00000383906 136 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PGAM1P2-201ENST00000436071 725 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL139022.1-202ENST00000553633 796 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CCDC89-201ENST00000316398 1412 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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