Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR2Q2VWA4 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CHST4-202ENST00000539698 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC005076.1-201ENST00000433446 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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