Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 SETDB1-202ENST00000368962 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 LINC01849-201ENST00000414647 517 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 TEPP-202ENST00000441824 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 DHRS4L1-201ENST00000558293 855 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC011472.2-201ENST00000586356 655 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AL356423.1-201ENST00000604953 538 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 TRAV38-2DV8-201ENST00000390465 395 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CYP2F2P-201ENST00000437853 1056 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AL132656.1-201ENST00000452173 490 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC006236.1-201ENST00000576249 797 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC012313.9-201ENST00000619318 633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC091941.1-201ENST00000623003 576 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CGREF1-209ENST00000640154 336 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 DMKN-202ENST00000392206 458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC004771.2-201ENST00000430920 439 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 LINC00877-202ENST00000464271 552 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CYB561A3-213ENST00000539890 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 MIR4296-201ENST00000581038 88 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 HAMP-201ENST00000222304 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC099681.2-201ENST00000449899 543 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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