Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.4 ms