Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms