Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR2E3Q9Y5X4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms