Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNX5Q9Y5X3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms