Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF1Q9Y4C2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF1Q9Y4C2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms