Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC43.32■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC43.32■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC43.3■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
DCAF1Q9Y4B6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
DCAF1Q9Y4B6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC43.17■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC43.16■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
DCAF1Q9Y4B6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms