Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RAD54L2Q9Y4B4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
RAD54L2Q9Y4B4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAD54L2Q9Y4B4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RAD54L2Q9Y4B4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms