Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms