Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAB39Q9Y376 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAB39Q9Y376 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms